PEMBELAJARAN KIMIA ONLINE

ChemSketch

Home »  Tutorial »  ChemSketch

ChemSketch

On Januari 7, 2016, Posted by , In Tutorial, By , , With No Comments

Tutorial Menggambar Struktur Molekul Menggunakan Aplikasi ChemSketch

ChemSketch merupakan aplikasi kimia yang digunakan untuk menggambar struktur kimia suatu molekul maupun senyawa kimia dengan optimalisasi sudut ikatan dan panjang ikatan yang sesuai dengan teori. Berikut adalah tutorial menggambar menggunakan aplikasi ChemSketch.

Membuka Aplikasi ChemSketch

1. Pastikan anda sudah menginstal software ChemSketch pada laptop atau komputer anda.

2. Untuk Windows 7, klik kiri Start > klik kiri All Programs > search dengan kata kunci “ChemSketch” > klik kiri dua kali pada icon 1

3. Untuk Windows 8, tekan tombol yang bergambar simbol Windows 8 pada keypad > ketik “ ChemSketch” > klik kiri icon ChemSketch pada tampilan software yang muncul, seperti berikut:

            2

Menggambar Manual (per atom)  dengan ChemSketch :

1. Apabila langkah yang anda gunakan benar akan muncul halaman seperti berikut:

            3

            Klik Ok > kemudian klik kiri Select All > klik kiri Yes > klik kiri Ok.

2. Maka muncul halaman editor untuk menggambarkan molekul.

           4

3. Misal untuk menggambar molekul histidin (asam amino) secara manual yaitu dengan memilih simbol C di sisi kiri halaman.

  5

4. Tempatkan pada posisi yang anda inginkan dan klik kiri dan lepaskan > klik kiri pada tengah molekul CH4 yang sebelumnya digambar dan tahan arahkan ke arah yang anda inginkan kemudian lepas > pilih simbol N di sebelah kiri halaman > dari tengah CH3 sebelah kiri klik kiri dan tahan arahkan ke kiri lalu lepas > pilih simbol O > dari tengah CH3 sebelah kanan klik kiri dan tahan arahkan ke pojok kanan atas lalu lepas > dari CH2 sebelah kanan klik kiri dan tahan arahkan ke pojok kanan bawah lalu lepas > maka akan didapatkan rantai lurus dari tryptofan seperti berikut:

6

5.  Tempatkan pada posisi yang anda inginkan dan klik kiri dan lepaskan > klik kiri pada tengah molekul CH4 yang sebelumnya digambar dan tahan arahkan ke arah yang anda inginkan kemudian lepas > pilih simbol N di sebelah kiri halaman > dari tengah CH3 sebelah kiri klik kiri dan tahan arahkan ke kiri lalu lepas > pilih simbol O > dari tengah CH3 sebelah kanan klik kiri dan tahan arahkan ke pojok kanan atas lalu lepas > dari CH2 sebelah kanan klik kiri dan tahan arahkan ke pojok kanan bawah lalu lepas > maka akan didapatkan rantai lurus dari tryptofan seperti berikut:

7

6.  Pada molekul histidine terdapat ikatan rangkap pada gugus fungsi karboksilat dan imidazolidine. Untuk mengganti ikatan tunggal menjadi rangkap dengan cara : pastikan pada menu Structure telah aktif > pilih icon Draw Normal > klik kiri pada salah satu sisi dan tahan lalu hubungkan sisi lainnya yang harus memiliki ikatan rangkap > lakukan hal yang sama untuk mengganti ikatan tunggal menjadi rangkap > didapatkan struktur histidin sebagai berikut:

8

7. Klik icon 3D Optimization untuk mendaptkan struktur 3 dimensi yang benar sehingga sudut dan panjang ikatan sesuai dengan aturan.

9

8. Save fie yang telah dibuat dengan klik File > Save As > pilih tempat penyimpanan > beri nama file > Save.

Menggambar Per Gugus Fungsi dengan Chemsketch :

1. Pilih simbol segi lima pada bagian kanan halaman > arahkan kursor ke halaman penulisan rumus > klik kiri sekali hingga terbentuk > pilih simbol N pada kiri halaman > klik CH2 pada segilima sebanyak dua C pada posisi 1 dan 3 > pilih Draw Normal klik pada garis yang akan diubah menjadi ikatan dobel > pilih simbol segi enam posisikan pada pojok kanan atas gambar sebelumnya > pilih Draw Normal klik dan tahan pada sudut atas segilima sampai ke sisi sudut ter dekat. Akan didapat gambar berikut:

10

2.  Klik Select / Move pada icon menu klik pada garis kanan bawah > delete > pilih simbol N pada sebelah kiri halaman > klik dan tahan pada sudut paling dekat dengan CH3 > pilih Select / Move pada icon menu > klik kiri pada tengah CH3 > pilih simbol COOH pada kanan halaman > klik kiri pada sebelah kanan C yang mengikat NH2 > pilih draw Normal > hubungkan C yang mengikat NH2 dengan C karboksilat >

11geser sudut ini ke arah ujung segilima sampai keduanya berhimpitan > drag gambar kedua > pilih 3D Optimization > didapt struktur yang identik dengan struktur yang didapatkan pada cara menggambar manual seperti berikut :

12

Untuk lebih lengkapnya, silahkan lihat pada video berikut:

 

 

Sekian Tutorial ChemSketch, semoga bermanfaat. TERIMAKASIH :)

 

 

Tinggalkan Balasan